海军工程大学的优势专业包括：

船舶与海洋工程：

该专业是海工大的顶尖专业之一，与海洋工程紧密相关，具有鲜明的海军特色。

兵器科学与技术：

涉及军事装备的研发和应用，与国家安全紧密相关。

电气工程：

包含电磁发射工程等专业，是海工大录取分数线较高的专业之一。

动力工程及工程热物理：

涉及能源转换和动力系统的设计与优化。

辐射防护与核安全：

与国家安全和核技术紧密相关，是海工大较为特色的专业。

通信工程：

随着信息技术的发展，通信工程在多个领域都有重要应用。

选择专业时，建议考虑个人兴趣、职业规划以及专业的就业前景。海工大作为一所具有鲜明海军特色的全国重点大学，其相关专业在军事领域及与海洋相关的工程领域具有很高的声誉和影响力。