在《X战警4》中， X教授确实复活了。关于X教授复活的原因和方式，存在以下几种解释：

意识转移：

在电影的最后，有彩蛋显示X教授进入到了一个植物人身体里面，万磁王开始恢复能力。此外，也有消息指出，X教授在临死前将自己大脑意志转移到另外一个植物人身上去了。

剧情需要：

有评论认为，X教授的复活可能是剧情需要，或者是为了满足粉丝的呼声。

综合以上信息，可以确定在《X战警4》中，X教授通过某种方式复活了，并且与万磁王联合起来。