除虫菊和玛格丽特菊（又称玛格丽特）虽然名称相似，但属于不同物种，主要区别如下：

一、植物学分类

除虫菊

- 属于菊科木茼蒿属草本植物，原名为木茼蒿，别名包括蓬蒿菊、东洋菊、法兰西菊、小牛眼菊等。

玛格丽特菊

- 严格意义上的玛格丽特菊属于菊科木菊属，与除虫菊同科但不同属。

二、原产地与分布

除虫菊：

原产南斯拉夫达尔马提亚地区，1917年由我国引种至江苏、浙江等地。

玛格丽特菊：原产北非加那利群岛，现广泛种植于全球多个地区，包括中国。

三、形态特征

除虫菊：

- 茎秆较粗壮，叶片呈羽状深裂，花色多为黄色或橙色，花型紧凑，常用于提取驱虫成分。

玛格丽特菊：

- 茎秆较细，叶片细长且边缘有锯齿，花型较大且呈杯状，花色丰富（如红色、紫色、白色等），观赏价值高。

四、用途差异

除虫菊：主要作为天然驱虫剂使用，其提取物（如除虫菊酯）具有驱蚊、驱虫效果。

玛格丽特菊：以观赏为主，适合盆栽、切花或地栽，花期长且适应性强。

总结

两者虽同属菊科，但属种、原产地、形态及用途均有明显差异。若需药用或驱虫，建议选择除虫菊；若以观赏为目的，则玛格丽特菊更合适。