乔峰在杀段正淳时， 并不知道段正淳是段誉的父亲。以下是相关原文信息：

乔峰的知情情况

在《天龙八部》原著中，乔峰在杀段正淳时，并不知道段正淳就是结义兄弟段誉的父亲。

乔峰在寻找段正淳时，并没有意识到段正淳与他的结拜兄弟段誉有任何关系，他的主要动机是报仇。

段誉的身份揭示

段誉在故事后期才逐渐揭露自己的身份，包括他是镇南王世子以及段正淳的儿子。

在乔峰与段正淳决斗时，段誉并未提及自己的身份，因此乔峰没有机会知道段正淳是他的父亲。

其他角色的影响

阿朱的死亡使得乔峰有机会了解真相，但阿朱并非段正淳，而是被陷害致死的。

最终，真相大白时，乔峰已经杀死了段正淳，因此他并没有机会在那时知道段正淳的真实身份。

综上所述，乔峰在杀段正淳时并不知道段正淳是段誉的父亲。