根据提供的信息，福建省内升格本科的院校包括：

厦门海洋职业技术学院：

升格后更名为厦门海洋职业大学。

黎明职业大学：

升格后保持原名，并在洛江校区建设中。

泉州医学高等专科学校：

升格后可能更名为泉州医学院或泉州健康医学院。

以上信息基于最近更新的数据，具体升格进度和更名情况请以官方最新公示为准。