在电视剧《小大夫》的大结局中，黄蓉和郭靖确实复婚了。以下是相关细节的梳理：

初次离婚

两人在剧中因误会和矛盾办理了离婚手续，主要原因包括黄蓉对郭靖的军功章有争议、黄蓉隐瞒自己做节育环的事实，以及郭靖不愿要孩子等。

误会解除与复婚

郭靖发现黄蓉的秘密后，虽然气愤，但最终两人解开误会并重新走到一起。剧中明确提到他们“解开误会又复婚了”。

家庭生活

复婚后，两人育有子女，其中两个孩子的名字分别为郭芙和郭襄。此外，剧中还涉及其他角色如韩皓月、袁媛等人的生活轨迹，但黄蓉和郭靖的婚姻关系是核心走向。

综上，黄蓉和郭靖在经历波折后，结局是复合并共同组建家庭。