生物生态系统的基本原理包括以下几个方面：

物质循环再生原理：

物质在生态系统中不断循环和再生，例如无废弃农业和沼气利用等实践。

物种多样性原理：

生物多样性是生态系统稳定和平衡的基础，不同物种在生态系统中占据不同的时间和空间位，形成复杂的食物链和食物网。

协调与平衡原理：

生态系统中的各个组成部分需要协调和平衡，例如三北防护林和沙漠防护林等工程。

整体性原理：

生态系统是一个整体，人类和动物等生物与自然环境之间存在相互依存和制约的关系。

能量流动原理：

生态系统中的能量通过光合作用和食物链在不同层次之间传递。

养分循环原理：

生态系统中的各种元素和化合物在不同生物体之间循环，例如土壤中的氮、磷等元素。

稳态平衡原理：

生态系统具有自我调节和恢复能力，能够在一定范围内保持稳定状态。

与环境适应性原理：

生物种群对其所处环境具有适应能力，这是其生存和繁殖的关键。

共生共存原理：

生态系统中的各种生物通过全球生物、地球、化学循环有机地联系起来，共同生活。

生态位原理：

每个物种在生态系统中占据特定的生态位，与其他物种相互依存和制约。

食物链原理：

食物链连接生态系统中的各种生物，描述了能量和物质的传递过程。

生态平衡原理：

生态系统在一定时间内处于稳定状态，其中所有生物和非生物环境因素相互协调、制约。

这些原理共同构成了生物生态系统的基本框架，有助于我们理解和维护生态系统的健康和可持续性。