南京市玄武区在新冠肺炎疫情期间，对严重阳性人员进行了集中管理。具体措施如下：

隔离治疗：

阳性人员已转运至市公卫医疗中心隔离治疗。

集中隔离：

对其住所同单元居民落实集中隔离管控措施。

终末消毒：

对其家中物品及周边环境进行采样及终末消毒。

临时封控：

对银城东苑小区主园区进行3天临时封控管理，并对主园区居民开展“三天两检”全员核酸检测。

这些措施表明，南京市玄武区在疫情期间对严重阳性人员实施了集中管理和隔离，以防止疫情扩散。