在《名侦探柯南》中，柯南变成工藤新一的情节发生在 第50话“外交官杀人事件”下集。在这一集中，柯南因为喝了从中国带来的老白干而暂时变回了工藤新一。这个变回的过程是意外的，并且新一的出现时间很短。在这短暂的时间里，新一找出了新的证据，否定了警察的自杀结论。当面具摘下来的那一刻，小兰发现那是自己心心念念的人，确认了对方是真的工藤新一。

此外，虽然存在一些关于柯南在其他剧集中短暂变回工藤新一的情节，但这些情节并不是主要的剧情线，且详细情况可能因不同来源而有所差异。因此，根据目前最可靠的信息，柯南在 第50话“外交官杀人事件”下集变回了工藤新一。