根据《母爱如山》剧情，王卓坐牢的原因如下：

核心结论

王卓因违规贷款导致东窗事发，最终被司法机关依法惩处。

详细分析

犯罪行为性质

王卓作为省城投资开发公司员工，因违规操作贷款，触犯法律条款，最终被查处并定罪。 *该行为直接导致其身份暴露，成为警方追捕对象，最终身陷囹圄。*

家庭背景关联

王卓与马娟（马娟饰）育有一子，但两人关系紧张，王卓对马娟存在抗拒心理，进一步加剧了其后续的犯罪动机。 *马娟作为家庭支柱，在王卓犯罪后承受了巨大的精神与经济压力。*

剧情推动作用

王卓的入狱成为剧情重要转折点，推动马娟从困境中觉醒，最终通过母爱感化王群（王群饰）改过自新。 *这一设定凸显了母爱的力量与救赎主题。*