番茄在下雨过后死亡的原因主要有以下几点：

根系受损 ：雨水温度低于土壤温度，导致根系受冷，细胞组织收缩或爆裂，吸收作用受到抑制。雨后转晴时，植株蒸腾作用加快，而根系供水不足，导致番茄发生大面积死苗或死棵现象。

土壤温度变化：

下过雨后，土壤温度迅速降低，晴天后温度又迅速升高，导致叶片光合作用减弱，根系功能减退，不能吸收充足的水分和养分，病菌容易蔓延，导致叶腐根烂。

水分供应不足：

番茄喜水但怕涝，田间长时间积水会导致土壤中氧气缺乏，番茄根系通过无氧呼吸制造能量，长时间无氧呼吸会产生酒精类物质，对根系细胞产生毒害，导致根系活力下降甚至死亡。

病害发生：

雨后的高温高湿环境非常有利于病害的发生和蔓延，例如疫霉根腐病、青枯病等根部病害及细菌性软腐病、疫病等。

肥害：

过量的肥料施用会导致根系周围的盐离子浓度过大，使根系尤其是毛细根受到伤害，不能正常吸收到养分，甚至出现反渗透现象，导致番茄根部营养物质外流，出现萎蔫症状。

建议

在雨后应及时检查番茄根系的生长情况，如发现根系出现红褐色，可能是长时间田间积水造成无氧呼吸中毒。

做好开沟排水和雨后的清沟沥水工作，避免田间长时间积水。

在施肥时应注意适量，避免过量施肥导致肥害。

在高温天气下，可以通过揭草苫等方式调节棚室内的温度，防止植株因温度过高而萎蔫。