伊犁哈萨克自治州拥有几所优秀的专科院校，以下是部分排名靠前和备受认可的专科学校：

伊犁职业技术学院

主管部门：新疆维吾尔自治区

所在地：伊犁哈萨克自治州

办学层次：专科

简介：伊犁职业技术学院是一所全日制公办普通高等院校，以农科为主，以畜牧兽医为特色，文理兼备。

新疆应用职业技术学院

主管部门：新疆维吾尔自治区

所在地：伊犁哈萨克自治州

办学层次：专科

简介：新疆应用职业技术学院是一所公办全日制普通高等职业院校，以培养应用型、技能型人才为主。

新疆石河子大学

主管部门：新疆维吾尔自治区

所在地：石河子市

办学层次：专科

简介：虽然不在伊犁地区，但作为新疆区内知名院校，也值得关注。

新疆农业大学

主管部门：新疆维吾尔自治区

所在地：乌鲁木齐市

办学层次：专科

简介：新疆农业大学是新疆区内重点建设的农业类高等学府。

以上排名不分先后，具体排名依据各校的师资力量、教学质量、科研成果、社会声誉等综合因素。