《越狱》第三季剧情主要围绕迈克尔·斯科菲尔德为救弟弟林肯、莎拉及侄子LJ展开，核心冲突为对抗“公司”与揭露真相。以下是关键信息整合：

剧情主线

- 麦克因替莎拉顶罪被关入巴拿马索纳监狱（SONA），林肯在狱外策划越狱以解救被绑架的LJ和莎拉。两人需在一周内完成高难度越狱任务。

- 越狱过程中，迈克尔与马洪、T-Bag等犯人合作，但需应对监狱内暴乱、新囚犯威胁及“公司”反派布设的陷阱。

核心冲突与转折

- 麦克被“公司”设计再次入狱，成为新目标。他需在索纳监狱内与犯人老大路赛罗周旋，同时避免其他越狱成员（如马洪、巴里克）的背叛。

- 林肯在狱外协助迈克尔，但两人被全国通缉，最终被引渡至索纳监狱，自由时间短暂。

结局与伏笔

- 越狱计划失败后，迈克尔被“公司”以新罪名关押，林肯继续对抗“公司”以揭露真相。剧情为后续季埋下伏笔，包括“公司”与政府背景的冲突升级。

总结：

第三季通过跨国监狱的冒险与智斗，强化了兄弟情与对抗腐败势力的主题，同时为系列终局奠定基础。