国家税务总局的内部机构设置可分为中央层面和地方层面两个维度，具体如下：

一、中央层面机构设置（13个司局）

根据国务院办公厅文件，国家税务总局设13个内设机构，正司局级，主要职责包括：

办公厅：

负责机关日常事务、税务宣传、政务公开等工作；

政策法规司：

起草税收法律法规草案，研究税制改革建议，承担税务行政复议等工作；

货物和劳务税司：

管理增值税、消费税等税种征收及出口退税；

所得税司：

负责企业所得税、个人所得税等征收管理；

财产和行为税司：

管理房产税、车船税等财产与行为税种；

国际税务司：

制定反避税措施，参与国际税收协议谈判；

收入规划核算司：

负责税收收入预测、统计分析等工作；

纳税服务司：

优化纳税服务流程，提升纳税人满意度；

征管和科技发展司：

推动税收征管现代化，应用信息技术提升效率；

大企业税收管理司：

针对大型企业实施专业化管理；

稽查局：

负责税收稽查工作；

财务管理司：

管理税务系统财务；

督察内审司：

开展内部审计和廉政监督。

二、地方层面机构设置

我国税务机构在中央统一领导下，分为省、计划单列市、地级市及县三级：

省级税务局 （31个）：正厅级，接受国家税务总局和省级党委政府双重领导，设职能处（如政策法规处、征管科技处等）；

计划单列市税务局（5个）：与省级税务局平级，直属国家税务总局管理，设职能处；

地级市/县税务局：

正科级至副厅级，接受上级税务局和地方政府双重领导，以地方政府为主。

三、其他说明

垂直管理特点：中央机构对省、市、县税务局实行垂直领导，确保政策统一；

双重领导机制：地方税务局在征管业务上接受上级税务局指导，在人事、财政上接受地方政府领导；

机构调整：部分职能曾划归中央机构（如财政部）或社会中介机构，后随职能调整恢复税务系统管理。

以上设置体现了中央集中与地方分权相结合的体制，既保障了税收政策的统一性，又兼顾了地方财政需求。