广深和谐号列车主要行驶在 广深铁路段，其运行方向为 从广州南站开往深圳北站。在平常日，深圳到广州的城际车（和谐号）以广州东终端为主，当然也有小部分终点是在广州站。但遇到春运等特殊情况，为确保其他方向的发车频率，深圳到广州的城际车会临时取消停靠广州站。

因此，无论是平常日还是春运期间，广深和谐号列车的运行方向都是从广州南站开往深圳北站。旅客在购买车票时应注意查看车次的终点站，以确保顺利到达目的地。