大众高尔夫6代1.4T手动版车型存在以下缺点：

优惠力度不大：

相比历代高尔夫，这一代高尔夫的优惠力度较小，可能让一些消费者感到不满意。

减配问题：

大众的减配相当不厚道，虽然内饰做工可以媲美中级车，但后门喇叭、门灯等配置被减配了。此外，轮胎也采用了较为一般的锦湖轮胎，虽然整体上不影响使用，但减配无疑影响了车辆的完整性和品质感。

车身尺寸变化：

这一代的高尔夫车身变得有棱有角，不再像5代和6代那样圆滚滚的，多了些阳刚之气，同时也似乎有点回归老高尔夫的外形设计。车身明显比高6要长和宽，这可能会影响一些消费者对于车辆空间和造型的喜好。

总体来说，虽然6代高尔夫1.4T手动版在外观和内饰做工上表现不错，但减配和优惠力度不足是其主要的缺点。建议消费者在购买时仔细考虑这些因素，以确保选购到最适合自己的车型。