《仙剑五》的结局存在多个版本，具体如下：

版本一

云帆的爸爸被封印，需要玉石。雨柔剩下3天的性命，两个只能选一个，或者自己死。云帆选择了自己死在施法过程中，雨柔冲出去抱着云帆，最后雨柔破坏法阵，化成了灰灵魂封在了玉石里。

云帆救出他爸爸之后，攻打蜀山，蜀山即将覆灭，之后云帆阻止他爸爸，他爸爸心软了，结果他爸爸有个更厉害的人在背后，出卖了他爸爸，结果他爸爸为了救云帆，牺牲了。

神魔之境已经破裂了，七圣唯有牺牲自己修复神魔之境。但是还少一个人，那个人选择了云帆，需要云帆寸步不离的一直守着神魔之境，也许1年，也许10年，也许100年。

因为神魔之境要重新封印了，从此没有裂缝，魔族的人从此不能再踏进人类世界了，所以龙幽唯有离开人界，离开小蛮，离开云帆兄弟，回到了魔族做自己的少爷。小蛮自然留在人界，可是他们两的心，在已属于对方的了。

几年后，云帆还是守着神魔之境，他头发变长了很多（很忧郁），突然，“云帆”（雨柔的声音）!云帆马上站了起来寻找声音的来源!可是，身边一个人也没有!然后，他脖子上带着的项链闪了一闪红光，那条项链，就是玉石。

版本二

打败幕后黑手大反派之后，七圣与云凡合力沉下蜀山封印神魔之井从此人魔两界隔开。雨柔牺牲自己救出姜世离，结局雨柔死了，神魔之井被封，小蛮与龙幽分隔两界，永世不得相见。云凡被告知女娲石灵气并未完全消失，于是在人界苦等数载，剧终。

版本三

姜世离决定用伏羲剑打破神魔之井封印，连通人魔两界，一起统一人魔两界。姜云凡绝不能看着天下苍生毁到自己父亲手里，于是返回蜀山，誓死捍卫蜀山。蜀山七圣一齐为云凡运功增加功力。龙幽小蛮情谊相挺，三人协力终于勉强和姜世离维持个平手。云凡龙幽小蛮跟魔翳殊死一战，但魔翳召唤出了魔族的最强武器，一个巨大的机关人。姜世离最后关头牺牲自己和魔翳同归于尽。蜀山七圣决定重新封印神魔之井，但是神魔之井重新封印后，人和人都不能以任何法术穿梭人魔两界了。女主角（唐雨柔）死了，男主角（姜云凡）要留在蜀山上至少百年守卫神魔之井的封印，男二、女二（龙幽、小蛮）生离，龙幽回了魔界（神魔之井封印之后除非重楼那种能力，否则任何法术不可通过）。最终动画中，神魔之井被重新封印了，龙幽回到魔族和小蛮永远分开了，姜云凡戴着那块有雨柔灵魂的血玉，多年后雨柔复活了，血玉叫了一声姜云凡，姜云凡大惊，起身观察，远处仙剑的标志物一群鹤飞过，同时姜云凡身上的血玉闪闪发光，全剧终。

版本四

蜀山大战之后，净天教有三成的人愿意留在蜀山，其他人希望前往魔界，而血手因为姜世离生死未卜，决定前往魔界一探究竟。海棠夫人这个时候出现，告诉姜云凡，那块血玉并未失去灵气，或许有一个温暖的灵魂在里面吧（唐雨柔），从此之后姜云凡一直带着那个血玉。太武掌门找到众人，告诉姜云凡，魔族虽退但是神魔之井打开，必须封印，众人决定自沉蜀山来封印神魔之井，修复封印需要八个人，蜀山七圣之外还少一个，希望姜云凡能够胜任。封印之后，任何法术都无法通过，封印之初甚为脆弱，需要八个人千年守护这封印。神魔之井被封印之后，任何法术都无法通过，意味着龙幽的传送法术也无法通过，答应魔翳做好夜叉族王的龙幽沉默了，小蛮不依，但是无法改变这个现实，含泪施法帮助蜀山七圣和姜云凡封印神魔之井。这个时候夜叉族的枯井开始出水，魔族大旱得以解决